Genetik Strain HIV-1 dan HIV-2

Muncul Strain Rekombinan Terus Menantang Peneliti

Salah satu hambatan utama untuk mengobati atau mengembangkan vaksin yang efektif untuk HIV adalah keragaman genetik yang tinggi dari virus itu sendiri. Sementara virus yang menggunakan DNA untai ganda untuk bereplikasi relatif stabil, retrovirus seperti HIV mundur dalam siklus replikasi mereka (menggunakan RNA strain tunggal) dan jauh kurang stabil. Akibatnya, HIV sangat rentan terhadap mutasi —mengutarnya, faktanya, sekitar satu juta kali lebih sering daripada sel yang menggunakan DNA.

Ketika keragaman genetika virus melebar dan berbagai jenis virus berbeda ditularkan dari orang ke orang, materi genetik campuran dapat menciptakan hibrida HIV baru. Sementara sebagian besar hibrida ini mati, beberapa yang bertahan hidup sering menunjukkan resistensi yang lebih besar terhadap terapi HIV dan, dalam beberapa kasus, perkembangan penyakit yang lebih cepat.

Variabilitas HIV, oleh karena itu, menciptakan sesuatu dari "target bergerak" untuk peneliti, dengan strain rekombinan (gabungan genetik) baru yang mampu menolak atau sama sekali menghindari agen penetralisir. Beberapa, seperti strain A3 / 02 yang diidentifikasi oleh peneliti Swedia pada 2013, mampu menguras pertahanan kekebalan seseorang jauh lebih agresif daripada strain yang dikenal sebelumnya.

Apa itu HIV-1 dan HIV-2?

Ada dua jenis HIV: HIV-1 dan HIV-2. HIV-1 dianggap sebagai tipe dominan, mewakili sebagian besar infeksi di seluruh dunia, sementara HIV-2 jauh kurang umum dan terutama terkonsentrasi di wilayah barat dan tengah Afrika.

Sementara kedua jenis HIV ini dapat menyebabkan AIDS , HIV-2 jauh lebih sulit untuk ditularkan dan jauh lebih mematikan daripada HIV-1.

Dalam masing-masing jenis HIV ini adalah sejumlah kelompok, subtipe ("clades"), dan sub-subtipe. Tidak diragukan lagi, subtipe dan strain rekombinan lainnya akan ditemukan ketika penyebaran global HIV berlanjut.

Kelompok dan Subtipe HIV-1

HIV-1 dibagi menjadi empat kelompok: Kelompok M (yang berarti "mayor"); Grup O (yang berarti "outlier," atau di luar tempat di mana kelompok lain terlihat); dan Grup N (yang berarti "non-M" dan "non-O"); dan Grup P (artinya "menunggu keputusan"). Empat kelompok yang berbeda diklasifikasikan oleh empat simian immunodeficiency virus (SIV) yang diketahui diloloskan dari kera atau simpanse ke manusia.

HIV-1 Grup M

HIV-1 Grup M adalah kelompok pertama yang diidentifikasi dan saat ini mewakili sekitar 90% kasus HIV di seluruh dunia dan dapat ditemukan hampir di setiap bagian planet ini. Dalam kelompok ini ada 10 subtipe, yang dapat dikelompokkan berdasarkan, antara lain, distribusi geografis mereka dan dampaknya pada kelompok risiko yang berbeda.

Kelompok HIV-1 O

HIV-1 Golongan O ditemukan pada tahun 1990 dan hanya mewakili 1% dari infeksi di seluruh dunia.

Kelompok HIV ini diisolasi di Kamerun dan negara-negara Afrika yang berdekatan.

HIV-1 Grup N

HIV-1 Grup N ditemukan pada tahun 1998 dan, sekali lagi, hanya terlihat di Kamerun dengan kurang dari 20 kasus yang didokumentasikan hingga saat ini.

Kelompok HIV-1 P

HIV-1 Grup P adalah tipe HIV yang langka, pertama kali diidentifikasi pada wanita dari Kamerun pada tahun 2009. Ini dapat dibedakan dari kelompok HIV lain sejauh asalnya telah dikaitkan dengan bentuk SIV yang ditemukan pada gorila barat. Meskipun klasifikasi "P" dimaksudkan untuk menyimpulkan status "tertunda" (yaitu, menunggu konfirmasi infeksi tambahan), kasus terdokumentasi kedua diidentifikasi pada tahun 2011 pada pria Kamerun.

Kelompok HIV-2

Meskipun kasus HIV-2 telah diidentifikasi di tempat lain, infeksi hampir secara eksklusif terlihat di Afrika. Saat ini ada delapan kelompok HIV-2, meskipun hanya subtipe A dan B adalah satu-satunya yang dianggap epidemi. HIV-2 diyakini telah menyeberang spesies dari jenis SIV yang mempengaruhi monyet mangabeys jelaga langsung ke manusia.

HIV-2 Grup A terutama terlihat di Afrika Barat, meskipun perjalanan internasional telah menyebabkan segelintir kecil kasus yang didokumentasikan di AS, Eropa, Brasil dan India. Sebaliknya, HIV-2 Grup B telah terbatas di beberapa bagian Afrika Barat.

Sumber:

Sharp, P. dan Hahn, B. "Asal-usul HIV dan AIDS Pandemi." Perspektif Cold Springs Harbor dalam Kedokteran. September 2011; 1 (1): a006841.

Palm A .; Esbjörnsson, J .; Månsson, F .; et al. "Kemajuan yang lebih cepat menjadi AIDS dan kematian terkait AIDS di antara individu terinfeksi yang terinfeksi dengan HIV / A3 rekombinan, CRF02_AG dibandingkan dengan sub-subtipe A3." Journal of Infectious Diseases. 1 Maret 2014; 209 (5): 721-728.

Vallari, A .; Holzmayer, V .; Harris, B .; et al. "Konfirmasi kelompok P HIV-1 yang menghukum di Kamerun." Jurnal Virologi. Februari 2011; 85 (3): 1403-1407.

Abecasis, A .; Wensig, A .; Paraskevis, D .; et al. “Distribusi subtipe HIV-1 dan determinan demografi pada pasien yang baru didiagnosis di Eropa menunjukkan epidemi yang sangat terkotak-kotak.” Retrovirologi. 14 Januari 2013; 10: 7; doi: 10.1186 / 1742-4690-10-7.