Pelajari lebih lanjut tentang strain spesies Paenibacillus VT 400
Pada musim panas 2016, pada pertemuan tahunan American Society for Microbiology, para ilmuwan berkumpul untuk berbagi dan mendiskusikan temuan yang berkaitan dengan dunia bakteri dan kesehatan manusia.
Di antara penemuan-penemuan itu, sebuah kelompok melaporkan seluruh genom, atau set lengkap gen, untuk bakteri yang disebut strain spesies Paenibacillus VT 400 (PVT400). Bakteri ini sebelumnya telah ditemukan dalam air liur pasien anak dengan leukemia limfoblastik akut (ALL).
Informasi rinci dari studi ini dan masa depan akan membantu para ilmuwan mengetahui apakah bakteri ini mungkin memiliki peran dalam penyakit manusia, terutama pada orang dengan leukemia akut yang mengembangkan pneumonia atau infeksi aliran darah.
Pneumonia pada Orang Dengan Kanker
Pneumonia adalah penyebab utama kematian pada pasien kanker dengan neutropenia, dan terutama mereka dengan leukemia akut. Neutropenia adalah jumlah neutrofil yang rendah dalam darah — neutrofil adalah sel darah putih yang penting dalam membantu tubuh melawan infeksi .
Infeksi saluran pernafasan bawah sangat umum di antara pasien kanker, dengan beberapa laporan menunjukkan bahwa 13 hingga 31 persen pasien leukemia yang menerima kemoterapi dan hingga 80 persen penerima transplantasi sel induk hematopoietik akan mengalami setidaknya satu episode pneumonia.
Pneumonia Neutropenia adalah infeksi yang berpotensi mengancam jiwa. Dalam skenario semacam itu, dokter segera memulai terapi antibiotik, tanpa menunggu hasil laboratorium untuk mengkonfirmasi dan menentukan jenis infeksi bakteri — karena sangat penting untuk memulai perawatan sekaligus, untuk mengurangi risiko bahwa pasien akan menyerah pada infeksi.
Bahkan, terapi pencegahan digunakan dalam keadaan tertentu, yang dijelaskan di bawah ini.
Kemajuan terbaru dalam manajemen pneumonia neutropenia memacu harapan untuk hasil yang lebih baik. Beberapa masyarakat medis telah mengeluarkan panduan terbaru untuk terapi antibiotik dugaan pneumonia neutropenik.
Dan ada kemungkinan bahwa agen baru yang mempromosikan respons tubuh terhadap infeksi dapat lebih meningkatkan aktivitas antibiotik.
Berfokus pada Patogen pada Pasien Dengan Neutropenia
Pedoman dari American Society of Clinical Oncology (ASCO) merekomendasikan bahwa dokter berusaha mencegah infeksi pada pasien rawat jalan dengan neutropenia mendalam tetapi tidak demam. Perawatan antibakteri dan antijamur disarankan jika neutrofil diharapkan tetap di bawah 100 / μL selama lebih dari tujuh hari. Pedoman menyatakan bahwa agen yang disukai untuk terapi pencegahan antibakteri adalah fluoroquinolone oral, sedangkan untuk terapi antijamur adalah triazole oral.
Pasien dengan neutropenia rentan terhadap berbagai patogen yang lebih luas daripada rekan-rekan mereka. Akan sangat membantu bagi dokter untuk mempertimbangkan darimana bakteri berasal dari memprediksi antibiotik mana yang kemungkinan akan resisten, dan oleh karena itu strategi mana yang paling efektif.
Spesies Paenibacillus
Untuk mencapai tujuan itu, para ilmuwan telah mempelajari PVT400, bakteri baru yang diisolasi dari pasien leukemia, anggota genus Paenibacillus — keluarga spesies bakteri berbentuk batang. Spesies yang berbeda dalam kelompok ini telah diisolasi dari tanah, air, tanaman, susu, dan tempat lainnya.
Namun, spesies Paenibacillus tidak diketahui menyebabkan penyakit manusia. .. hingga laporan terbaru menunjukkan kemungkinan keterlibatan tiga spesies Paenibacillus yang berbeda dalam penyakit manusia.
Setelah PVT 400 diisolasi dari air liur pasien pediatrik dengan leukemia limfoblastik akut , studi awal menunjukkan beberapa kesamaan dari isolat ini dengan spesies amilolitikus, yang ditemukan di larrel hindgut lalat; Namun, hingga saat ini, masih benar bahwa P. amylolyticus belum terdeteksi pada manusia, dan penelitian lebih lanjut menunjukkan perbedaan antara strain-VT 400 bakteri yang ditemukan pada pasien kanker dan P. lainnya.
strain amilolitikus.
Jadi, ketika para peneliti mempelajari keseluruhan genome VT 400, ada sejumlah temuan menarik. Itu gen yang mengkode mekanisme resistensi obat kemoterapi , seperti tunikamycin dan bleomycin. Mereka juga menemukan gen untuk pompa bakteri yang terkait dengan resistensi multiobat, serta gen yang mengkode resistensi terhadap antibiotik, termasuk vankomisin, fosmidomisin, tetrasiklin serta obat-obatan seperti penisilin, atau beta-laktam.
Para penulis studi genom ini mencatat bahwa urutan genom lengkap Paenibacillus sp. strain VT 400 akan membantu menentukan peran spesies Paenibacillus pada penyakit manusia dan memberikan wawasan ke dalam komposisi bakteri normal yang hidup pada pasien dengan kanker darah.
Sumber:
> Evans SE, Ost DE. Pneumonia pada pasien kanker neutropenia. Curr Opin Pulm Med . 2015; 21 (3): 260-271.
Rybakova D, Wetzlinger U, Müller H, et al. Urutan genom lengkap Paenibacillus polymyxa strain SB3-1, bakteri tanah dengan aktivitas antagonis terhadap patogen tanaman. Genome Announc . 2015; 3 (2): e00052-15.
De Souza R, Sant'Anna FH, Ambrosini A, dkk. Genome Pseudomonas sp. FeS53a, bakteri pemicu pertumbuhan tanaman yang diduga berasosiasi dengan padi yang ditanam di tanah dengan tekanan besi. Genome Announc. 2015; (2): e00248-15. 10.1128 / genomeA.00248-15.
Spence R, Demchick P, Hornitzky M, dkk. Surveilans perlebahan Selandia Baru untuk Paenibacillus alvei. NZ Entomol . 2013; 36: 82–86.
Kim KK, Lee KC, Yu H, dkk. Paenibacillus sputi sp. November., diisolasi dari dahak pasien dengan penyakit paru. Int J Syst Evol Microbiol . 2010; 60: 2371-2377.
Mulcahy N. Panduan ASCO baru tentang neutropenia dan demam. Berita Medscape Medical. 16 Jan 2013. Tersedia di http://www.medscape.com/viewarticle/777736.
Bunga CR, Seidenfeld J, Bow EJ, dkk. Antimikroba profilaksis dan manajemen rawat jalan demam dan neutropenia pada orang dewasa yang diobati untuk keganasan: American Society of Clinical Oncology pedoman praktik klinis . J Clin Oncol . 2013; 31 (6): 794-810.